شبکه کلمه / عباس عبدی، فعال سیاسی و روزنامه نگار اصلاح طلب، در یادداشتی، مواضع متناقض باقری، مذاکره‌کننده ایرانی در وین را مورد نقد و بررسی قرار داد.
وی در این یادداشت نوشت:
هنگامی که از آقای باقری مذاکره‌کننده ایرانی می‌پرسد که از این برجام متعفن (به قول آقای باقری) چه چیزی کم و زیاد شده که اکنون مبنای توافق پیشنهادی شما شده است؟
به یک نقل وی پاسخ داده که آن زمان کنشگر سیاسی بوده و به نقل دیگری گفته‌اند که: «آن زمان من منتقد و کارشناس بودم؛ اکنون اما تابع نظر دولت مستقر هستم.»
مذاکره کردن مثل مُرده‌شوری نیست که هر مرده‌ای با هر ایمانی و اخلاقی و عملکردی را بتوان شست و برای مُرده‌شور فرقی نکند. مذاکره سیاسی از تعهد و درک کارشناسی و سیاسی بیرون می‌آید.